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學院設有“綜合辦公室/學生工作辦公室”“人才培養辦公室”“醫院管理辦公室”“科研與學科建設辦公室”4個正處級行政管理機構，組成單位包括：基礎醫學院、藥學院、公共衛生學院、護理學院、附屬第一醫院(第一臨床學院)、附屬第二醫院(第二臨床學院)、附屬南華醫院(南華臨床學院)、附屬長沙中心醫院(長沙中心醫院臨床學院)、附屬第三醫院(第三臨床學院)、附屬公共衛生醫院、附屬第七醫院等15家附屬醫院（其中4所直屬三甲綜合性醫院），擁有一級學科博士后科研流動站1個（基礎醫學），一級學科博士學位授權點2個（基礎醫學、臨床醫學），一級學科碩士學位授權點6個（基礎醫學、臨床醫學、生物學、藥學、公共衛生與預防醫學、護理學），碩士專業學位授權類別4種（臨床醫學、藥學、公共衛生碩士、護理學），醫學類本科專業11個，形成了完整的醫學人才培養體系，并在本科、碩士和博士層次招收來華留學生，具有推薦優秀應屆本科畢業生免試攻讀碩士學位研究生資格和碩-博連讀招生資格。現有全日制本科生7509人，博士、碩士研究生5466人，國際學生372人(含博士、碩士46人）。